Figura. El cráneo de Quetzalcoatlus

El cráneo de Quetzalcoatlus presenta una morfología extremadamente alargada, característica de los azdárquidos gigantes. El rostro domina gran parte de la longitud cefálica y termina en un pico edentado, sin dientes, probablemente cubierto en vida por una ranfoteca queratinizada. Una gran fenestra nasoanteorbital ocupa buena parte de la región anterior, contribuyendo al aligeramiento craneal sin eliminar las barras óseas necesarias para mantener la resistencia estructural durante la alimentación y el movimiento de la cabeza.

La región posterior del cráneo es comparativamente compacta y presenta una órbita reducida en proporción al rostro, además de una marcada cresta craneal dorsal. Esta cresta probablemente participó en comunicación visual, reconocimiento intraespecífico o exhibición, aunque su función exacta continúa siendo discutida. La ausencia de dentición representa una condición altamente derivada dentro de Pterosauria y se relaciona con un aparato alimentario basado en un pico largo y rígido, más apropiado para capturar o recoger presas que para perforarlas con dientes.

La enorme longitud del cráneo debió integrarse funcionalmente con un cuello extraordinariamente elongado y vértebras cervicales especializadas. A pesar de su tamaño, la cabeza podía mantenerse relativamente ligera gracias a la fenestración extensa, paredes óseas delgadas y cavidades neumáticas. Esta combinación permitió a Quetzalcoatlus alcanzar grandes dimensiones sin convertir el extremo del cuello en una carga excesiva. El cráneo refleja así una especialización extrema de Azhdarchidae, donde edentulia, elongación rostral, reducción de masa y gigantismo corporal evolucionaron de manera coordinada con la locomoción terrestre y el vuelo activo.