En 1925 presentó su tesis doctoral, considerada una de las más importantes de la historia de la astronomía. Aplicando la teoría de ionización de Meghnad Saha al estudio de los espectros estelares, demostró que las diferencias entre los espectros observados dependían principalmente de la temperatura de las estrellas y no de composiciones químicas distintas, como se creía hasta entonces. Su análisis reveló además que el hidrógeno era, con gran diferencia, el elemento más abundante en las estrellas, seguido por el helio. Esta conclusión resultó tan revolucionaria que inicialmente fue cuestionada por destacados astrónomos. Poco tiempo después, nuevas investigaciones confirmaron plenamente sus resultados, estableciendo que el hidrógeno constituye el principal componente del Sol y de la mayoría de las estrellas del universo.
A lo largo de su trayectoria, Cecilia Payne-Gaposchkin publicó numerosos trabajos sobre estrellas variables, evolución estelar y estructura de la Vía Láctea. En 1934 contrajo matrimonio con el astrónomo Sergei Gaposchkin, con quien desarrolló diversas investigaciones. En 1956 se convirtió en la primera mujer nombrada profesora titular y directora de departamento en la Universidad de Harvard, rompiendo importantes barreras para las científicas. Su legado trascendió sus descubrimientos sobre la composición estelar, pues abrió nuevas oportunidades para las mujeres en la investigación astronómica. Hoy es reconocida como una de las figuras más influyentes de la astrofísica del siglo XX y una pionera en la aplicación de la espectroscopia al estudio del universo.
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